Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 CAVIN2-201ENST00000304141 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 ATP2C1-204ENST00000428331 4795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 KDM4C-202ENST00000381309 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 ZSCAN26-206ENST00000619937 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 GHR-212ENST00000620156 4529 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 MAGOHB-201ENST00000320756 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 ZNF304-202ENST00000391705 4313 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 ATP5E-201ENST00000243997 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 SERPINB6-202ENST00000380520 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRHP20396 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 TMEM237-203ENST00000409883 5415 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AP000977.1-201ENST00000501964 2908 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 PPP4R1L-202ENST00000334187 2746 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 PRICKLE2-204ENST00000564377 8032 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 THNSL2-201ENST00000324166 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 EPHA5-206ENST00000622150 8421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 LINC02436-202ENST00000509017 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 SNX19P1-201ENST00000444901 2981 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC010368.1-201ENST00000510160 456 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC129908.1-201ENST00000624553 648 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 NAALAD2-210ENST00000534061 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 LINC00461-212ENST00000511014 3539 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 PFKFB1-202ENST00000375006 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 PKD1L2-205ENST00000527937 4165 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 ZNF252P-208ENST00000592792 2485 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 CD44-206ENST00000415148 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 LRTOMT-202ENST00000307198 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC092645.1-201ENST00000624058 2272 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TRHP20396 RCAN1-207ENST00000481448 2816 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 CAMK2D-214ENST00000515496 1533 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 FLNB-AS1-202ENST00000488720 3709 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC009163.7-201ENST00000621929 2557 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 SIMC1-201ENST00000332772 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 FAM74A4-203ENST00000621724 1862 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 GNA12-203ENST00000407904 3918 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 NCKAP5-201ENST00000317721 7593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 NCKAP5-205ENST00000409261 7594 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 ZFP30-204ENST00000514101 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TRHP20396 STPG1-203ENST00000374409 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms