Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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HOXD8P13378 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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HOXD8P13378 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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HOXD8P13378 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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