Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms