Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
ERVV-1B6SEH8 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms