Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms