Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL589666.2-201ENST00000624603 618 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00598-212ENST00000637124 905 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH18-205ENST00000511115 1331 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FHL1-230ENST00000630084 1335 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CU633967.1-204ENST00000624627 1604 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 GSTM2-204ENST00000369831 1730 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP26-201ENST00000410247 293 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL606534.2-201ENST00000436756 624 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC074257.1-201ENST00000446340 585 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL591438.2-201ENST00000452635 691 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL135908.1-202ENST00000454135 562 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD21-AS1-204ENST00000528468 554 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC136944.5-201ENST00000573021 151 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC018521.6-201ENST00000584276 335 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC006547.1-211ENST00000609191 828 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC245028.3-201ENST00000618197 285 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC079801.1-201ENST00000623753 388 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD8-207ENST00000513559 1813 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RAD9B-207ENST00000409778 1373 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms