Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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