Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SFRP4Q6FHJ7 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms