Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 KIAA1644-201ENST00000381176 6751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NRP1-207ENST00000374875 5407 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SYT2-201ENST00000367267 7614 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ERC1-213ENST00000543086 9241 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ACAN-206ENST00000559004 7628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NCKAP5-201ENST00000317721 7593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NCKAP5-205ENST00000409261 7594 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 EPHA5-206ENST00000622150 8421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ARHGEF9-222ENST00000636048 5059 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SIM1-202ENST00000369208 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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