Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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SMCO1Q147U7 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC099777.1-201ENST00000603779 1070 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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