Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFTN1Q14699 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms