Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CBFBQ13951 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms