Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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CDH18Q13634 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CDH18Q13634 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CDH18Q13634 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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CDH18Q13634 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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