Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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CUL3Q13618 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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CUL3Q13618 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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CUL3Q13618 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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CUL3Q13618 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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CUL3Q13618 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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CUL3Q13618 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL3Q13618 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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