Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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