Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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