Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 WNT2B-201ENST00000256640 2819 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 UCA1-201ENST00000397381 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SETD5-201ENST00000302463 4786 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CSMD1-202ENST00000400186 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CSMD1-217ENST00000602723 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RFPL4B-201ENST00000441065 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HERC2P3-206ENST00000429257 4088 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TTC23-203ENST00000394132 3849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 MSH4-201ENST00000263187 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SLC22A9-201ENST00000279178 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AGBL4-204ENST00000371839 2947 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HEATR5A-201ENST00000382464 507 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 MIR637-201ENST00000385000 99 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 FCAR-207ENST00000391725 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HPN-AS1-201ENST00000392227 1124 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL445235.1-201ENST00000431202 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC004917.1-202ENST00000475791 760 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 GNPDA1-212ENST00000513454 980 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ALG1L12P-201ENST00000515046 434 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LINC02134-201ENST00000562980 557 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL121830.1-203ENST00000598694 701 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL591926.6-201ENST00000617375 415 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL590644.1-202ENST00000634972 590 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CELF2-205ENST00000542579 7982 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LUCAT1-203ENST00000513626 2672 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ZNF442-201ENST00000242804 6219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PNMA8A-202ENST00000438932 3335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 C2-201ENST00000299367 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PLA2G4A-201ENST00000367466 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HEATR9-204ENST00000603870 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LINC02181-201ENST00000430050 4083 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PARL-212ENST00000639100 1513 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 OSBPL3-203ENST00000396431 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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MKRN4PQ13434 CDH26-202ENST00000348616 3182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 FAM107A-201ENST00000360997 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 TCTN3-207ENST00000614499 2739 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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MKRN4PQ13434 CCL22-201ENST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 BBS7-201ENST00000264499 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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MKRN4PQ13434 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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MKRN4PQ13434 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 OR51R1P-201ENST00000435309 952 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC002064.1-201ENST00000445784 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC087521.2-203ENST00000530450 593 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC138466.2-201ENST00000540993 304 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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