Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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IFT88Q13099 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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IFT88Q13099 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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IFT88Q13099 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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IFT88Q13099 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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IFT88Q13099 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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IFT88Q13099 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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