Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms