Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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