Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GLI3P10071 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GLI3P10071 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GLI3P10071 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GLI3P10071 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GLI3P10071 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GLI3P10071 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GLI3P10071 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
GLI3P10071 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GLI3P10071 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GLI3P10071 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GLI3P10071 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms