Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 PIGN-230ENST00000638977 4601 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 ERG-204ENST00000398907 4809 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 GK5-201ENST00000392993 9837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 KIF24-201ENST00000379174 5729 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 SLC25A14P1-201ENST00000502867 901 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 PLCXD2-205ENST00000636933 7710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKHD1P08F94 PIGN-251ENST00000640876 6045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms