Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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APAF1O14727 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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APAF1O14727 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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APAF1O14727 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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APAF1O14727 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
APAF1O14727 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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APAF1O14727 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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APAF1O14727 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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APAF1O14727 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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APAF1O14727 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
APAF1O14727 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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APAF1O14727 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
APAF1O14727 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APAF1O14727 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
APAF1O14727 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APAF1O14727 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APAF1O14727 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
APAF1O14727 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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