Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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