Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PDGFDQ9GZP0 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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