Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.5 ms