Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RNA5-8SP2-201ENST00000363564 152 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SNORA9B-201ENST00000384170 133 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC01799-201ENST00000411701 386 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC119677.1-201ENST00000414199 471 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FAF2P1-201ENST00000429974 1298 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL772155.1-201ENST00000431077 347 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL359094.1-210ENST00000432554 730 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RALY-AS1-202ENST00000432859 610 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DAB1-AS1-203ENST00000432897 656 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AQP4-203ENST00000440832 1169 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC073465.3-201ENST00000448468 405 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL135908.1-202ENST00000454135 562 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 OR7E100P-201ENST00000489105 1015 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC138866.1-201ENST00000514522 497 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC034154.1-202ENST00000518105 691 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MAFA-AS1-201ENST00000519762 417 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MED30-204ENST00000522839 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FDPSP4-201ENST00000534629 1049 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC012038.1-201ENST00000551279 552 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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ANKRD39Q53RE8 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC025278.2-201ENST00000598153 1063 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AQP4-208ENST00000622234 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CDKL5-209ENST00000635828 3823 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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