Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms