Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FSCN1Q16658 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms