Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TRAV6-201ENST00000390428 404 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PDCD6IPP2-205ENST00000565892 498 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 FHL5-203ENST00000541107 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
FXNQ16595 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms