Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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