Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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BRD3Q15059 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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BRD3Q15059 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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BRD3Q15059 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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BRD3Q15059 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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BRD3Q15059 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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BRD3Q15059 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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