Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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COL4A6Q14031 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL4A6Q14031 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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