Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms