Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms