Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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IFT88Q13099 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFT88Q13099 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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