Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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FOXF1Q12946 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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FOXF1Q12946 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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