Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SLFN5Q08AF3 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms