Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.5 ms