Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms