Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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