Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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