Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD8P13378 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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