Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD2APQ9Y5K6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD2APQ9Y5K6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms