Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms