Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP3Q9Y2W1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms