Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1024Q9UPX6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms