Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INO80Q9ULG1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
INO80Q9ULG1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms