Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms