Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CFDP1Q9UEE9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFDP1Q9UEE9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms